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Vie d'équipe

Pycuda appliqué pour Metropolis-Hastings

  • Utilisation d'une GPU pour distribuer des calculs dans le cadre de méthodes Monte-Carlo.
  • Exemple d'application pour de l'échantillonnage sur la sphère S2.

Slides de la présentation: Pycuda appliqué pour Metropolis-Hastings

Scripts de la présentation: Scripts pycuda

 

Utilisation de la grille de calcul

Présentation de la grille (http://calcul-wiki.univ-lille1.fr):

  • La grille dispose de 2000 CPU cores, 7000 GPU cores. Elle dispose aussi d'un espace de stockage de 156 To. Cependant, éviter de stocker les données ou les résultats là-bas et les rapatrier régulièrement en local.
  • L'équipe SIGMA a participé via l'achat d'une carte GPU NVidia K80 pour le noeud appelé "K80". Pour la demande d'inscription, se référer au wiki.
  • Pour l'utilisation, se connecter en ssh: <login_lille1>@calcul-hpc.univ-lille1.fr où <login_lille1> désigne le même login que celui utilisé pour votre boîte mail Lille1 ou encore la centrale de réservation de voyages Lille1.
  • Les différents jobs sont managés par PBS. Il faut par conséquent écrire un fichier de configuration PBS pour lancer un job. Des tutoriaux sont disponibles sur internet. En particulier, il est important de spécifier le temps de calcul estimé pour être redirigé vers la bonne file d'attente.
  • Penser à la commande "module load" dans le fichier PBS pour utiliser matlab, anaconda, etc. En ligne de commande, "module avail" liste les modules disponibles.
  • Contacter Matthieu Marquillie en cas de pépin, très réactif.
  • Pour avoir accès à la grille de chez vous, il faut un accès VPN.

Slides de la présentation: Utilisation de la grille de calcul de Lille 1